Отказ гражданину РФ в праве на выезд из Российской Федерации может быть обжалован в суде.

В случае если выезд из Российской Федерации гражданина РФ ограничен в связи с допуском к сведениям, имеющим степень секретности «особой важности» или «совершенно секретно», и фактической работой с ними, его заграничный паспорт подлежит передаче на хранение до истечения срока временного ограничения в государственный орган, осуществивший выдачу паспорта.

Военнослужащие Вооруженных Сил РФ, а также федеральных органов исполнительной власти, в которых предусмотрена военная служба, за исключением лиц, проходящих военную службу по призыву, выезжают из Российской Федерации при наличии разрешения командования, оформленного в порядке, определенном постановлением Правительства РФ от 19 декабря 1997 г. № 1598. При этом выезд военнослужащих из Российской Федерации (за исключением военнослужащих Службы внешней разведки РФ и Федеральной службы охраны РФ) подлежит согласованию с соответствующими органами Федеральной службы безопасности РФ.

Разрешение на выезд из Российской Федерации военнослужащих Вооруженных Сил РФ, а также федеральных органов исполнительной власти, в которых предусмотрена военная служба, дается Министром обороны РФ и руководителями соответствующих федеральных органов исполнительной власти или уполномоченными ими лицами.

В целях выявления законных оснований для возможного временного ограничения права гражданина на выезд за границу государственный орган, оформляющий документ, удостоверяющий личность гражданина, по которому последний осуществляет выезд из Российской Федерации, согласует вопрос выезда этого гражданина за границу с соответствующим органом безопасности.